Układ trawienny odpowiada za rozkład pokarmu, wchłanianie składników odżywczych oraz usuwanie resztek z organizmu. Trawienie zaczyna się już w jamie ustnej, a następnie pokarm przechodzi przez przełyk, żołądek, jelito cienkie i jelito grube. Zdrowie jelit ma znaczenie nie tylko dla trawienia, ale także dla odporności i ogólnego samopoczucia. W celiakii gluten wywołuje przewlekły stan zapalny jelita cienkiego, co może prowadzić do zaburzeń wchłaniania składników odżywczych i objawów takich jak wzdęcia, biegunka, zaparcia, zmęczenie czy niedobory.